إن من بين أهم الإجراءات العملية التي اعتمدتها الدولة لإنجاح مخطط المغرب الأخضر، مشروع إعادة هيكلة وزارة الفلاحة بحيث سيقتصر دورها على الضبط والتتبع والمواكبة، على أن الدور العملي لتفعيل مخطط المغرب الأخضر سيعهد لوكالة التنمية الفلاحية كآلية جديدة، وذلك عير 3 أدوار وهي : 

وهكذا فإن مهام وكالة التنمية ستتركز في فيما يخص :

و عهد إليها اقتراح للسلطات الحكومية برامج العمل تتعلق بدعم السلاسل الفلاحية ذات القيمة المضافة العالية و ذلك من أجل تحسين الإنتاجية و سيتم ذلك عبر :
-  البحث و تسخير العقار قصد توسيع المدارات الفلاحية و تنمية زراعات ذات قيمة مضافة عالية
- التحفيز على تثمين المنتوجات الفلاحية عبر وضع أنظمة جديدة للسقي، لتجهيزات الضيعات الفلاحية و للتوضيب و للتسويق.
- تشجيع الاستثمارات الفلاحية و خلق شراكات مع المستثمرين.
كما عهد إلى وكالة التنمية الفلاحية تقديم اقتراحات إلى السلطات الحكومية برامج العمل تتعلق بدعم الفلاحة التضامنية عبر تشجيع وضع مشاريع ذات جدوى اقتصادية قصد تحسين دخل الفلاحين.